Áudio: Dublado

A primeira temporada é a fase introdutória da série animada, onde os primeiros X-Men formadores do Instituto Xavier, Professor X (Charles Xavier), Ciclope (Scott Summers), Wolverine (Logan Howller), Tempestade (Ororo Munroe) e Jean Grey, recrutam novos integrantes: Noturno (Kurt Wagner), Lince Negra (Katherine “Kitty” Pride), Spyke (Evan Daniels) e Vampira(Anna Marie). Noturno descobre a verdade sobre sua mãe, Wolverine encontra respostas sobre seu passado, Vampira passa da Irmandade de Mutantes para os X-Men, as lutas constantes entre Wolverine e Dentes-de-Sabre se tornam freqüentes e o irmão de Xavier, Fanático(Cain Marko), é solto da prisão.Confrontos contra a Irmandade para conseguir novos recrutas se desenvolvem por toda a temporada. A Irmandade, inicialmente formada por Groxo (Todd Tolansky), Mercúrio (Pietro Maximoff), Blob (Fredy Dukes) e Avalanche (Lance Alvers) que aparentemente era comandada pela Mística (Raven Darkholme), é na verdade comandada por Magneto(Erik Magnus Leencherr).
Depois que Ciclope encontra seu irmão, Alex Masters/Summers (Destrutor), que sobreviveu a queda de avião que matou seus pais, eles são levados por Magneto para seu “Santuário” dentro do Asteróide M. Magneto captura os mutantes mais poderosos da Irmandade e dos X-Men para amplificar seu poder e remover as emoções, numa tentativa de “salvar” a espécie mutante de possíveis confrontos futuros com a humanidade, porém, nesse jogo de escolha, os resultados são inesperados e com destaque, a derrota de Mística pela Tempestade, faz com que a Irmandade se desfaça numa briga entre Mística e Magneto. Asteróide M foi destruído por Scott e Alex Summers, mas não antes de Magneto, Dentes-de-Sabre e Mística conseguirem escapar. Professor Xavier e os X-Men retornam à rotina normal.




Episódio 01
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Episódio 02
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Episódio 03
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Episódio 04
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Episódio 05
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Episódio 06
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Episódio 07
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Episódio 08
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Episódio 09
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Episódio 12 e 13
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